Es un medicamento de la familia llamada inhibidores de la bomba de protones, encargado de inhibir o bloquear la secreción ácida que producen las células parietales que se encuentran en la mucosa del estómago, favoreciendo la cicatrización de las lesiones gástricas en caso de que existan.
Se utiliza como tratamiento en esofagitis por ERGE (enfermedad por reflujo gastroesofágico) calmando los síntomas de acidez, reflujo, dolor al tragar, etc.
También está indicado para las úlceras pépticas de difícil tratamiento, gastritis y duodenitis, ya sea aguda o crónica.
En la esofagitis leve a moderada el alivio de los síntomas se alcanza entre las 2 y 4 semanas de tratamiento, aunque, se pueden presentar cambios desde el inicio.
La dosis que utilizamos para enfermedades como hernia hiatal, esofagitis por reflujo, úlcera péptica por Helicobacter pylori, gastritis, duodenitis aguda y crónica, gastritis erosiva, gastritis medicamentosa (por antiinflamatorios no esteroideos y otros), es de 1 gragea al día. De acuerdo con la respuesta del paciente, algunos podrían requerir incrementar la dosis a  2 grageas al día (40 mg).
En niños de 8 años que pesen 20 kg o más, el tratamiento de la esofagitis leve a moderada, es también de 1 gragea de pantoprazol 20 mg al día.